Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC96Q2M329 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms