Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDR2Q16832 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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