Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPROQ16827 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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