Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FXNQ16595 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FXNQ16595 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FXNQ16595 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FXNQ16595 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FXNQ16595 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FXNQ16595 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FXNQ16595 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FXNQ16595 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FXNQ16595 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FXNQ16595 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FXNQ16595 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FXNQ16595 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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