Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCBQ16585 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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