Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6AP1Q15904 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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