Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITSN1Q15811 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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