Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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