Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SS18Q15532 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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SS18Q15532 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SS18Q15532 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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