Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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EBI3Q14213 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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EBI3Q14213 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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