Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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