Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPA4Q13156 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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