Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN2AQ12879 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
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