Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms