Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMARCB1Q12824 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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