Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGNL1Q0VF96 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms