Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNB2Q08289 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms