Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSME1Q06323 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSME1Q06323 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms