Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
REG3AQ06141 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms