Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP27A1Q02318 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP27A1Q02318 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms