Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TUBB4BP68371 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms