Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK-24P63145 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms