Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms