Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COPZ1P61923 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms