Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-21P61565 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms