Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNAP25P60880 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms