Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCDC1P59894 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms