Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC00313P59037 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms