Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN12P56749 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN12P56749 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN12P56749 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN12P56749 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CLDN12P56749 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN12P56749 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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