Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RANGAP1P46060 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RANGAP1P46060 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms