Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV4P43268 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV4P43268 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV4P43268 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV4P43268 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV4P43268 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms