Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LTBRP36941 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LTBRP36941 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms