Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFTPDP35247 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFTPDP35247 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFTPDP35247 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFTPDP35247 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms