Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPN7P35236 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms