Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NTF4P34130 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NTF4P34130 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NTF4P34130 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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