Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms