Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CRABP1P29762 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CRABP1P29762 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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