Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms