Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTSSP25774 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CTSSP25774 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTSSP25774 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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