Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APCP25054 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APCP25054 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APCP25054 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APCP25054 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APCP25054 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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