Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNA2P20248 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms