Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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