Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms