Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DESP17661 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DESP17661 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DESP17661 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DESP17661 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DESP17661 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms