Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCL3L1P16619 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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