Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DSPP15924 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DSPP15924 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DSPP15924 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms