Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA4P13612 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms