Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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DEFA4P12838 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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DEFA4P12838 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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DEFA4P12838 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA4P12838 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA4P12838 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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