Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTMAP06454 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTMAP06454 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTMAP06454 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTMAP06454 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTMAP06454 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTMAP06454 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTMAP06454 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTMAP06454 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms