Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms